Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXL3

Uncharacterized protein C7orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CXL3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CXL3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CXL3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CXL3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CXL3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9CXL3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9CXL3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9CXL3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms