Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXC3

Mgme1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgme1Q9CXC3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mgme1Q9CXC3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mgme1Q9CXC3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mgme1Q9CXC3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mgme1Q9CXC3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mgme1Q9CXC3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mgme1Q9CXC3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mgme1Q9CXC3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mgme1Q9CXC3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mgme1Q9CXC3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms