Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tdrd12Q9CWU0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tdrd12Q9CWU0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tdrd12Q9CWU0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tdrd12Q9CWU0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tdrd12Q9CWU0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tdrd12Q9CWU0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tdrd12Q9CWU0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tdrd12Q9CWU0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tdrd12Q9CWU0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tdrd12Q9CWU0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tdrd12Q9CWU0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tdrd12Q9CWU0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tdrd12Q9CWU0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tdrd12Q9CWU0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tdrd12Q9CWU0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tdrd12Q9CWU0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tdrd12Q9CWU0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tdrd12Q9CWU0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tdrd12Q9CWU0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tdrd12Q9CWU0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tdrd12Q9CWU0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tdrd12Q9CWU0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tdrd12Q9CWU0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tdrd12Q9CWU0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tdrd12Q9CWU0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tdrd12Q9CWU0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tdrd12Q9CWU0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tdrd12Q9CWU0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tdrd12Q9CWU0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tdrd12Q9CWU0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tdrd12Q9CWU0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tdrd12Q9CWU0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tdrd12Q9CWU0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tdrd12Q9CWU0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tdrd12Q9CWU0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tdrd12Q9CWU0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tdrd12Q9CWU0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tdrd12Q9CWU0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tdrd12Q9CWU0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tdrd12Q9CWU0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tdrd12Q9CWU0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tdrd12Q9CWU0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tdrd12Q9CWU0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tdrd12Q9CWU0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tdrd12Q9CWU0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tdrd12Q9CWU0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Tdrd12Q9CWU0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tdrd12Q9CWU0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tdrd12Q9CWU0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tdrd12Q9CWU0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tdrd12Q9CWU0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tdrd12Q9CWU0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Tdrd12Q9CWU0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tdrd12Q9CWU0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Tdrd12Q9CWU0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tdrd12Q9CWU0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tdrd12Q9CWU0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tdrd12Q9CWU0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tdrd12Q9CWU0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tdrd12Q9CWU0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tdrd12Q9CWU0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tdrd12Q9CWU0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Tdrd12Q9CWU0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tdrd12Q9CWU0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Tdrd12Q9CWU0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms