Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Sycp2Q9CUU3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Sycp2Q9CUU3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Sycp2Q9CUU3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Sycp2Q9CUU3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Sycp2Q9CUU3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Sycp2Q9CUU3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Sycp2Q9CUU3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Sycp2Q9CUU3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Sycp2Q9CUU3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Sycp2Q9CUU3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Sycp2Q9CUU3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Sycp2Q9CUU3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Sycp2Q9CUU3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Sycp2Q9CUU3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Sycp2Q9CUU3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Sycp2Q9CUU3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Sycp2Q9CUU3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Sycp2Q9CUU3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Sycp2Q9CUU3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Sycp2Q9CUU3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Sycp2Q9CUU3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Sycp2Q9CUU3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Sycp2Q9CUU3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
Sycp2Q9CUU3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
Sycp2Q9CUU3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Sycp2Q9CUU3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Sycp2Q9CUU3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Sycp2Q9CUU3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Sycp2Q9CUU3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Sycp2Q9CUU3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Sycp2Q9CUU3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC34■■■■□ 3.03
Sycp2Q9CUU3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Sycp2Q9CUU3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Sycp2Q9CUU3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Sycp2Q9CUU3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Sycp2Q9CUU3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Sycp2Q9CUU3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Sycp2Q9CUU3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Sycp2Q9CUU3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Sycp2Q9CUU3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Sycp2Q9CUU3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Sycp2Q9CUU3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Sycp2Q9CUU3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Sycp2Q9CUU3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Sycp2Q9CUU3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Sycp2Q9CUU3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Sycp2Q9CUU3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Sycp2Q9CUU3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Sycp2Q9CUU3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Sycp2Q9CUU3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Sycp2Q9CUU3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Sycp2Q9CUU3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Sycp2Q9CUU3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Sycp2Q9CUU3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Sycp2Q9CUU3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Sycp2Q9CUU3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Sycp2Q9CUU3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Sycp2Q9CUU3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Sycp2Q9CUU3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
Sycp2Q9CUU3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Sycp2Q9CUU3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.02
Sycp2Q9CUU3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Sycp2Q9CUU3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Sycp2Q9CUU3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Sycp2Q9CUU3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Sycp2Q9CUU3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Sycp2Q9CUU3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Sycp2Q9CUU3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Sycp2Q9CUU3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Sycp2Q9CUU3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Sycp2Q9CUU3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Sycp2Q9CUU3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Sycp2Q9CUU3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Sycp2Q9CUU3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Sycp2Q9CUU3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Sycp2Q9CUU3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Sycp2Q9CUU3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Sycp2Q9CUU3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Sycp2Q9CUU3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
Sycp2Q9CUU3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Sycp2Q9CUU3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Sycp2Q9CUU3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Sycp2Q9CUU3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Sycp2Q9CUU3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Sycp2Q9CUU3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Sycp2Q9CUU3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Sycp2Q9CUU3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Sycp2Q9CUU3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Sycp2Q9CUU3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Sycp2Q9CUU3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Sycp2Q9CUU3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Sycp2Q9CUU3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Sycp2Q9CUU3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Sycp2Q9CUU3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Sycp2Q9CUU3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Sycp2Q9CUU3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Sycp2Q9CUU3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
Sycp2Q9CUU3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Sycp2Q9CUU3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms