Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUS9

Sppl3, Signal peptide peptidase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl3Q9CUS9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms