Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smurf1Q9CUN6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smurf1Q9CUN6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smurf1Q9CUN6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smurf1Q9CUN6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smurf1Q9CUN6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smurf1Q9CUN6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smurf1Q9CUN6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smurf1Q9CUN6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smurf1Q9CUN6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smurf1Q9CUN6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Smurf1Q9CUN6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smurf1Q9CUN6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smurf1Q9CUN6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smurf1Q9CUN6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smurf1Q9CUN6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smurf1Q9CUN6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smurf1Q9CUN6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms