Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms