Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR56

Nkiras2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras2Q9CR56 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nkiras2Q9CR56 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nkiras2Q9CR56 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms