Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR55

UPF0547 protein C16orf87 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CR55 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CR55 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CR55 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CR55 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CR55 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CR55 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CR55 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CR55 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CR55 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CR55 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CR55 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CR55 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CR55 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CR55 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CR55 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CR55 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CR55 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CR55 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9CR55 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9CR55 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9CR55 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9CR55 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9CR55 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9CR55 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9CR55 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9CR55 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9CR55 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9CR55 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9CR55 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9CR55 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9CR55 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9CR55 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9CR55 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CR55 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CR55 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CR55 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CR55 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CR55 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CR55 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CR55 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CR55 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CR55 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CR55 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CR55 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CR55 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CR55 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CR55 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CR55 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CR55 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CR55 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CR55 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CR55 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CR55 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CR55 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CR55 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CR55 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CR55 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CR55 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CR55 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CR55 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CR55 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CR55 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CR55 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CR55 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CR55 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CR55 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CR55 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CR55 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CR55 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CR55 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CR55 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CR55 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CR55 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CR55 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CR55 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CR55 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CR55 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CR55 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CR55 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CR55 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CR55 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CR55 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CR55 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CR55 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CR55 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CR55 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CR55 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CR55 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CR55 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CR55 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CR55 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CR55 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CR55 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CR55 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CR55 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CR55 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CR55 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CR55 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CR55 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CR55 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms