Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms