Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4931417E11RikQ9CR05 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms