Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS5

Riok2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok2Q9CQS5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Riok2Q9CQS5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Riok2Q9CQS5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Riok2Q9CQS5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Riok2Q9CQS5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Riok2Q9CQS5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Riok2Q9CQS5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Riok2Q9CQS5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Riok2Q9CQS5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Riok2Q9CQS5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Riok2Q9CQS5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Riok2Q9CQS5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Riok2Q9CQS5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Riok2Q9CQS5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Riok2Q9CQS5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Riok2Q9CQS5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Riok2Q9CQS5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Riok2Q9CQS5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Riok2Q9CQS5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Riok2Q9CQS5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Riok2Q9CQS5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Riok2Q9CQS5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Riok2Q9CQS5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Riok2Q9CQS5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Riok2Q9CQS5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms