Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms