Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rdm1Q9CQK3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rdm1Q9CQK3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rdm1Q9CQK3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rdm1Q9CQK3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rdm1Q9CQK3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rdm1Q9CQK3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rdm1Q9CQK3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rdm1Q9CQK3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rdm1Q9CQK3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rdm1Q9CQK3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rdm1Q9CQK3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rdm1Q9CQK3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rdm1Q9CQK3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rdm1Q9CQK3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rdm1Q9CQK3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rdm1Q9CQK3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rdm1Q9CQK3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rdm1Q9CQK3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rdm1Q9CQK3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rdm1Q9CQK3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rdm1Q9CQK3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rdm1Q9CQK3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rdm1Q9CQK3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rdm1Q9CQK3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rdm1Q9CQK3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rdm1Q9CQK3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rdm1Q9CQK3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rdm1Q9CQK3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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