Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nipsnap3bQ9CQE1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms