Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA5

Med4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med4Q9CQA5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Med4Q9CQA5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Med4Q9CQA5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Med4Q9CQA5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Med4Q9CQA5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Med4Q9CQA5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Med4Q9CQA5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Med4Q9CQA5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Med4Q9CQA5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Med4Q9CQA5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Med4Q9CQA5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Med4Q9CQA5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Med4Q9CQA5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Med4Q9CQA5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Med4Q9CQA5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Med4Q9CQA5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Med4Q9CQA5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Med4Q9CQA5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Med4Q9CQA5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Med4Q9CQA5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Med4Q9CQA5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Med4Q9CQA5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Med4Q9CQA5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Med4Q9CQA5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Med4Q9CQA5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Med4Q9CQA5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Med4Q9CQA5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Med4Q9CQA5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Med4Q9CQA5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Med4Q9CQA5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Med4Q9CQA5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Med4Q9CQA5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Med4Q9CQA5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Med4Q9CQA5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Med4Q9CQA5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Med4Q9CQA5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Med4Q9CQA5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Med4Q9CQA5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Med4Q9CQA5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Med4Q9CQA5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Med4Q9CQA5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Med4Q9CQA5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Med4Q9CQA5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Med4Q9CQA5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Med4Q9CQA5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Med4Q9CQA5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Med4Q9CQA5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Med4Q9CQA5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Med4Q9CQA5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Med4Q9CQA5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Med4Q9CQA5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Med4Q9CQA5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Med4Q9CQA5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Med4Q9CQA5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Med4Q9CQA5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Med4Q9CQA5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Med4Q9CQA5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Med4Q9CQA5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Med4Q9CQA5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Med4Q9CQA5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Med4Q9CQA5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Med4Q9CQA5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Med4Q9CQA5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Med4Q9CQA5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Med4Q9CQA5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Med4Q9CQA5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Med4Q9CQA5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Med4Q9CQA5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Med4Q9CQA5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Med4Q9CQA5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Med4Q9CQA5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Med4Q9CQA5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Med4Q9CQA5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Med4Q9CQA5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Med4Q9CQA5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Med4Q9CQA5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Med4Q9CQA5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Med4Q9CQA5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Med4Q9CQA5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Med4Q9CQA5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Med4Q9CQA5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Med4Q9CQA5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Med4Q9CQA5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Med4Q9CQA5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Med4Q9CQA5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Med4Q9CQA5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Med4Q9CQA5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Med4Q9CQA5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Med4Q9CQA5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Med4Q9CQA5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Med4Q9CQA5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Med4Q9CQA5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Med4Q9CQA5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Med4Q9CQA5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Med4Q9CQA5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Med4Q9CQA5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Med4Q9CQA5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Med4Q9CQA5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Med4Q9CQA5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Med4Q9CQA5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms