Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ90

Uncharacterized protein C9orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQ90 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQ90 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQ90 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQ90 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQ90 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQ90 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQ90 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQ90 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQ90 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CQ90 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9CQ90 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms