Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms