Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms