Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim26Q99PN3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim26Q99PN3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim26Q99PN3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim26Q99PN3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim26Q99PN3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim26Q99PN3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim26Q99PN3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim26Q99PN3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim26Q99PN3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim26Q99PN3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim26Q99PN3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim26Q99PN3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim26Q99PN3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim26Q99PN3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim26Q99PN3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim26Q99PN3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim26Q99PN3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim26Q99PN3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim26Q99PN3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim26Q99PN3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim26Q99PN3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim26Q99PN3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim26Q99PN3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms