Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scd3Q99PL7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scd3Q99PL7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms