Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rrbp1Q99PL5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rrbp1Q99PL5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Rrbp1Q99PL5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rrbp1Q99PL5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Rrbp1Q99PL5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rrbp1Q99PL5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rrbp1Q99PL5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rrbp1Q99PL5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rrbp1Q99PL5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rrbp1Q99PL5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Rrbp1Q99PL5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rrbp1Q99PL5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rrbp1Q99PL5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rrbp1Q99PL5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rrbp1Q99PL5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rrbp1Q99PL5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rrbp1Q99PL5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rrbp1Q99PL5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rrbp1Q99PL5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rrbp1Q99PL5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rrbp1Q99PL5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rrbp1Q99PL5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Rrbp1Q99PL5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rrbp1Q99PL5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rrbp1Q99PL5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rrbp1Q99PL5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rrbp1Q99PL5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Rrbp1Q99PL5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Rrbp1Q99PL5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rrbp1Q99PL5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rrbp1Q99PL5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rrbp1Q99PL5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rrbp1Q99PL5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rrbp1Q99PL5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rrbp1Q99PL5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rrbp1Q99PL5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rrbp1Q99PL5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Rrbp1Q99PL5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rrbp1Q99PL5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rrbp1Q99PL5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rrbp1Q99PL5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rrbp1Q99PL5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rrbp1Q99PL5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Rrbp1Q99PL5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rrbp1Q99PL5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rrbp1Q99PL5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rrbp1Q99PL5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rrbp1Q99PL5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rrbp1Q99PL5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rrbp1Q99PL5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rrbp1Q99PL5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rrbp1Q99PL5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rrbp1Q99PL5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rrbp1Q99PL5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Rrbp1Q99PL5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rrbp1Q99PL5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Rrbp1Q99PL5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rrbp1Q99PL5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rrbp1Q99PL5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rrbp1Q99PL5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rrbp1Q99PL5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rrbp1Q99PL5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rrbp1Q99PL5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rrbp1Q99PL5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rrbp1Q99PL5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rrbp1Q99PL5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rrbp1Q99PL5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rrbp1Q99PL5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rrbp1Q99PL5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Rrbp1Q99PL5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rrbp1Q99PL5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rrbp1Q99PL5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rrbp1Q99PL5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rrbp1Q99PL5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rrbp1Q99PL5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rrbp1Q99PL5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rrbp1Q99PL5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rrbp1Q99PL5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Rrbp1Q99PL5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rrbp1Q99PL5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rrbp1Q99PL5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rrbp1Q99PL5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rrbp1Q99PL5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rrbp1Q99PL5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rrbp1Q99PL5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rrbp1Q99PL5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rrbp1Q99PL5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rrbp1Q99PL5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rrbp1Q99PL5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rrbp1Q99PL5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rrbp1Q99PL5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rrbp1Q99PL5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rrbp1Q99PL5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rrbp1Q99PL5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rrbp1Q99PL5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rrbp1Q99PL5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rrbp1Q99PL5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rrbp1Q99PL5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rrbp1Q99PL5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms