Protein–RNA interactions for Protein: Q99PJ2

Trim8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim8Q99PJ2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim8Q99PJ2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms