Protein–RNA interactions for Protein: Q99P58

Rab27b, Ras-related protein Rab-27B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab27bQ99P58 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab27bQ99P58 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab27bQ99P58 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms