Protein–RNA interactions for Protein: Q99P51

Rassf3, Ras association domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf3Q99P51 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Rassf3Q99P51 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rassf3Q99P51 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rassf3Q99P51 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rassf3Q99P51 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rassf3Q99P51 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rassf3Q99P51 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rassf3Q99P51 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rassf3Q99P51 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rassf3Q99P51 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rassf3Q99P51 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rassf3Q99P51 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rassf3Q99P51 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rassf3Q99P51 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rassf3Q99P51 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rassf3Q99P51 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rassf3Q99P51 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rassf3Q99P51 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rassf3Q99P51 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rassf3Q99P51 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rassf3Q99P51 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rassf3Q99P51 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rassf3Q99P51 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rassf3Q99P51 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rassf3Q99P51 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rassf3Q99P51 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rassf3Q99P51 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rassf3Q99P51 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rassf3Q99P51 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rassf3Q99P51 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rassf3Q99P51 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rassf3Q99P51 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rassf3Q99P51 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rassf3Q99P51 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rassf3Q99P51 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms