Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RtcbQ99LF4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RtcbQ99LF4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RtcbQ99LF4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RtcbQ99LF4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RtcbQ99LF4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RtcbQ99LF4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RtcbQ99LF4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RtcbQ99LF4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RtcbQ99LF4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RtcbQ99LF4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RtcbQ99LF4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RtcbQ99LF4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RtcbQ99LF4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RtcbQ99LF4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RtcbQ99LF4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RtcbQ99LF4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RtcbQ99LF4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RtcbQ99LF4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RtcbQ99LF4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RtcbQ99LF4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RtcbQ99LF4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RtcbQ99LF4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RtcbQ99LF4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RtcbQ99LF4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RtcbQ99LF4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RtcbQ99LF4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RtcbQ99LF4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RtcbQ99LF4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RtcbQ99LF4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RtcbQ99LF4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RtcbQ99LF4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RtcbQ99LF4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RtcbQ99LF4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RtcbQ99LF4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RtcbQ99LF4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RtcbQ99LF4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RtcbQ99LF4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RtcbQ99LF4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RtcbQ99LF4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RtcbQ99LF4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RtcbQ99LF4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RtcbQ99LF4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RtcbQ99LF4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RtcbQ99LF4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RtcbQ99LF4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RtcbQ99LF4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RtcbQ99LF4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RtcbQ99LF4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RtcbQ99LF4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RtcbQ99LF4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RtcbQ99LF4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RtcbQ99LF4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RtcbQ99LF4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RtcbQ99LF4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RtcbQ99LF4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RtcbQ99LF4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RtcbQ99LF4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RtcbQ99LF4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RtcbQ99LF4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RtcbQ99LF4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RtcbQ99LF4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RtcbQ99LF4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RtcbQ99LF4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RtcbQ99LF4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RtcbQ99LF4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RtcbQ99LF4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RtcbQ99LF4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RtcbQ99LF4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RtcbQ99LF4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RtcbQ99LF4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RtcbQ99LF4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RtcbQ99LF4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RtcbQ99LF4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RtcbQ99LF4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms