Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmp1Q99KU0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms