Protein–RNA interactions for Protein: Q99KS2

Ngrn, Neugrin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgrnQ99KS2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NgrnQ99KS2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NgrnQ99KS2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NgrnQ99KS2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NgrnQ99KS2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NgrnQ99KS2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms