Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Clint1Q99KN9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Clint1Q99KN9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Clint1Q99KN9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Clint1Q99KN9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Clint1Q99KN9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Clint1Q99KN9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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