Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN1

Arrdc1, Arrestin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arrdc1Q99KN1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arrdc1Q99KN1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arrdc1Q99KN1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arrdc1Q99KN1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arrdc1Q99KN1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arrdc1Q99KN1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms