Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab28Q99KL7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms