Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms