Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

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Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn2aQ99KJ0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms