Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms