Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nlgn1Q99K10 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nlgn1Q99K10 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nlgn1Q99K10 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nlgn1Q99K10 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nlgn1Q99K10 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nlgn1Q99K10 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nlgn1Q99K10 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nlgn1Q99K10 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nlgn1Q99K10 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nlgn1Q99K10 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nlgn1Q99K10 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Nlgn1Q99K10 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nlgn1Q99K10 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nlgn1Q99K10 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nlgn1Q99K10 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nlgn1Q99K10 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nlgn1Q99K10 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nlgn1Q99K10 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nlgn1Q99K10 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Nlgn1Q99K10 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nlgn1Q99K10 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nlgn1Q99K10 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Nlgn1Q99K10 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nlgn1Q99K10 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nlgn1Q99K10 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nlgn1Q99K10 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nlgn1Q99K10 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nlgn1Q99K10 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms