Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms