Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan1Q99J59 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms