Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms