Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SptssbQ925E8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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