Protein–RNA interactions for Protein: Q924L1

Letmd1, LETM1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Letmd1Q924L1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Letmd1Q924L1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Letmd1Q924L1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Letmd1Q924L1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Letmd1Q924L1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Letmd1Q924L1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Letmd1Q924L1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Letmd1Q924L1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Letmd1Q924L1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Letmd1Q924L1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Letmd1Q924L1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Letmd1Q924L1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Letmd1Q924L1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Letmd1Q924L1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Letmd1Q924L1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Letmd1Q924L1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Letmd1Q924L1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Letmd1Q924L1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Letmd1Q924L1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Letmd1Q924L1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Letmd1Q924L1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Letmd1Q924L1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Letmd1Q924L1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Letmd1Q924L1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Letmd1Q924L1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Letmd1Q924L1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Letmd1Q924L1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Letmd1Q924L1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Letmd1Q924L1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Letmd1Q924L1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Letmd1Q924L1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Letmd1Q924L1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Letmd1Q924L1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Letmd1Q924L1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Letmd1Q924L1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Letmd1Q924L1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Letmd1Q924L1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Letmd1Q924L1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Letmd1Q924L1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Letmd1Q924L1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Letmd1Q924L1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Letmd1Q924L1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Letmd1Q924L1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Letmd1Q924L1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Letmd1Q924L1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Letmd1Q924L1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Letmd1Q924L1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Letmd1Q924L1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Letmd1Q924L1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Letmd1Q924L1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Letmd1Q924L1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Letmd1Q924L1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Letmd1Q924L1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Letmd1Q924L1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Letmd1Q924L1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Letmd1Q924L1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Letmd1Q924L1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Letmd1Q924L1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Letmd1Q924L1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Letmd1Q924L1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Letmd1Q924L1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Letmd1Q924L1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Letmd1Q924L1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Letmd1Q924L1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Letmd1Q924L1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Letmd1Q924L1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Letmd1Q924L1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Letmd1Q924L1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Letmd1Q924L1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Letmd1Q924L1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Letmd1Q924L1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Letmd1Q924L1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Letmd1Q924L1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Letmd1Q924L1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Letmd1Q924L1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Letmd1Q924L1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Letmd1Q924L1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Letmd1Q924L1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Letmd1Q924L1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Letmd1Q924L1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Letmd1Q924L1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Letmd1Q924L1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Letmd1Q924L1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Letmd1Q924L1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Letmd1Q924L1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Letmd1Q924L1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Letmd1Q924L1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Letmd1Q924L1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Letmd1Q924L1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Letmd1Q924L1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Letmd1Q924L1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Letmd1Q924L1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Letmd1Q924L1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Letmd1Q924L1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Letmd1Q924L1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Letmd1Q924L1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Letmd1Q924L1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Letmd1Q924L1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Letmd1Q924L1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Letmd1Q924L1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms