Protein–RNA interactions for Protein: Q924D0

Rtn4ip1, Reticulon-4-interacting protein 1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4ip1Q924D0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtn4ip1Q924D0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtn4ip1Q924D0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms