Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b5Q923D4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms