Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nrif1Q923B3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrif1Q923B3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms