Protein–RNA interactions for Protein: Q922Q2

Riok1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok1Q922Q2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Riok1Q922Q2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Riok1Q922Q2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Riok1Q922Q2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Riok1Q922Q2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Riok1Q922Q2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Riok1Q922Q2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Riok1Q922Q2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Riok1Q922Q2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Riok1Q922Q2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Riok1Q922Q2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Riok1Q922Q2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Riok1Q922Q2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Riok1Q922Q2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Riok1Q922Q2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Riok1Q922Q2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Riok1Q922Q2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Riok1Q922Q2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Riok1Q922Q2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Riok1Q922Q2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Riok1Q922Q2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Riok1Q922Q2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Riok1Q922Q2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Riok1Q922Q2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Riok1Q922Q2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Riok1Q922Q2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Riok1Q922Q2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Riok1Q922Q2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Riok1Q922Q2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Riok1Q922Q2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Riok1Q922Q2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Riok1Q922Q2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Riok1Q922Q2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Riok1Q922Q2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Riok1Q922Q2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Riok1Q922Q2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Riok1Q922Q2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Riok1Q922Q2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Riok1Q922Q2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Riok1Q922Q2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Riok1Q922Q2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Riok1Q922Q2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Riok1Q922Q2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Riok1Q922Q2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Riok1Q922Q2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Riok1Q922Q2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Riok1Q922Q2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Riok1Q922Q2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Riok1Q922Q2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Riok1Q922Q2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Riok1Q922Q2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Riok1Q922Q2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Riok1Q922Q2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Riok1Q922Q2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Riok1Q922Q2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Riok1Q922Q2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Riok1Q922Q2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Riok1Q922Q2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Riok1Q922Q2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Riok1Q922Q2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Riok1Q922Q2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Riok1Q922Q2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Riok1Q922Q2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Riok1Q922Q2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Riok1Q922Q2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Riok1Q922Q2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Riok1Q922Q2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Riok1Q922Q2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Riok1Q922Q2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms