Protein–RNA interactions for Protein: Q920C4

Ms4a3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a3Q920C4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ms4a3Q920C4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ms4a3Q920C4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Ms4a3Q920C4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Ms4a3Q920C4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Ms4a3Q920C4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Ms4a3Q920C4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ms4a3Q920C4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a3Q920C4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ms4a3Q920C4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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