Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarca5Q91ZW3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.4 ms