Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZU9

Grin3b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3bQ91ZU9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Grin3bQ91ZU9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Grin3bQ91ZU9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Grin3bQ91ZU9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grin3bQ91ZU9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grin3bQ91ZU9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grin3bQ91ZU9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grin3bQ91ZU9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Grin3bQ91ZU9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grin3bQ91ZU9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grin3bQ91ZU9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grin3bQ91ZU9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grin3bQ91ZU9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grin3bQ91ZU9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grin3bQ91ZU9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grin3bQ91ZU9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Grin3bQ91ZU9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Grin3bQ91ZU9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Grin3bQ91ZU9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Grin3bQ91ZU9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Grin3bQ91ZU9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Grin3bQ91ZU9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Grin3bQ91ZU9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Grin3bQ91ZU9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Grin3bQ91ZU9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Grin3bQ91ZU9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Grin3bQ91ZU9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Grin3bQ91ZU9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Grin3bQ91ZU9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Grin3bQ91ZU9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Grin3bQ91ZU9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Grin3bQ91ZU9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Grin3bQ91ZU9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Grin3bQ91ZU9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Grin3bQ91ZU9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Grin3bQ91ZU9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Grin3bQ91ZU9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Grin3bQ91ZU9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Grin3bQ91ZU9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Grin3bQ91ZU9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Grin3bQ91ZU9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Grin3bQ91ZU9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Grin3bQ91ZU9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Grin3bQ91ZU9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Grin3bQ91ZU9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Grin3bQ91ZU9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Grin3bQ91ZU9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Grin3bQ91ZU9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Grin3bQ91ZU9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Grin3bQ91ZU9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Grin3bQ91ZU9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Grin3bQ91ZU9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Grin3bQ91ZU9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Grin3bQ91ZU9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Grin3bQ91ZU9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Grin3bQ91ZU9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Grin3bQ91ZU9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Grin3bQ91ZU9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Grin3bQ91ZU9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Grin3bQ91ZU9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Grin3bQ91ZU9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Grin3bQ91ZU9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Grin3bQ91ZU9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Grin3bQ91ZU9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Grin3bQ91ZU9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Grin3bQ91ZU9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Grin3bQ91ZU9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Grin3bQ91ZU9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Grin3bQ91ZU9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Grin3bQ91ZU9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Grin3bQ91ZU9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Grin3bQ91ZU9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Grin3bQ91ZU9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Grin3bQ91ZU9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Grin3bQ91ZU9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Grin3bQ91ZU9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grin3bQ91ZU9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grin3bQ91ZU9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grin3bQ91ZU9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Grin3bQ91ZU9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Grin3bQ91ZU9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grin3bQ91ZU9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grin3bQ91ZU9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grin3bQ91ZU9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grin3bQ91ZU9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grin3bQ91ZU9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Grin3bQ91ZU9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Grin3bQ91ZU9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Grin3bQ91ZU9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Grin3bQ91ZU9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Grin3bQ91ZU9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Grin3bQ91ZU9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Grin3bQ91ZU9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Grin3bQ91ZU9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grin3bQ91ZU9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grin3bQ91ZU9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grin3bQ91ZU9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grin3bQ91ZU9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grin3bQ91ZU9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grin3bQ91ZU9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms