Protein–RNA interactions for Protein: Q91YI1

Atg13, Autophagy-related protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg13Q91YI1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg13Q91YI1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg13Q91YI1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg13Q91YI1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg13Q91YI1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg13Q91YI1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg13Q91YI1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg13Q91YI1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg13Q91YI1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg13Q91YI1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg13Q91YI1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg13Q91YI1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg13Q91YI1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg13Q91YI1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg13Q91YI1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg13Q91YI1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg13Q91YI1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg13Q91YI1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg13Q91YI1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg13Q91YI1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg13Q91YI1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg13Q91YI1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg13Q91YI1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg13Q91YI1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg13Q91YI1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg13Q91YI1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg13Q91YI1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg13Q91YI1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg13Q91YI1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg13Q91YI1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg13Q91YI1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg13Q91YI1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg13Q91YI1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg13Q91YI1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg13Q91YI1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg13Q91YI1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg13Q91YI1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg13Q91YI1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg13Q91YI1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg13Q91YI1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg13Q91YI1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg13Q91YI1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg13Q91YI1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg13Q91YI1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg13Q91YI1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg13Q91YI1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg13Q91YI1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg13Q91YI1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg13Q91YI1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg13Q91YI1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg13Q91YI1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg13Q91YI1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg13Q91YI1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg13Q91YI1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg13Q91YI1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg13Q91YI1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg13Q91YI1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg13Q91YI1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg13Q91YI1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg13Q91YI1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg13Q91YI1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg13Q91YI1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atg13Q91YI1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atg13Q91YI1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atg13Q91YI1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atg13Q91YI1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atg13Q91YI1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg13Q91YI1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg13Q91YI1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg13Q91YI1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg13Q91YI1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg13Q91YI1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg13Q91YI1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg13Q91YI1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg13Q91YI1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg13Q91YI1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg13Q91YI1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg13Q91YI1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg13Q91YI1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg13Q91YI1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg13Q91YI1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg13Q91YI1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg13Q91YI1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg13Q91YI1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg13Q91YI1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg13Q91YI1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg13Q91YI1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg13Q91YI1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg13Q91YI1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg13Q91YI1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg13Q91YI1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg13Q91YI1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg13Q91YI1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg13Q91YI1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg13Q91YI1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg13Q91YI1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg13Q91YI1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg13Q91YI1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg13Q91YI1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg13Q91YI1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms