Protein–RNA interactions for Protein: Q91XS1

Mtmr4, Myotubularin-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr4Q91XS1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mtmr4Q91XS1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mtmr4Q91XS1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mtmr4Q91XS1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mtmr4Q91XS1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mtmr4Q91XS1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mtmr4Q91XS1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mtmr4Q91XS1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mtmr4Q91XS1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mtmr4Q91XS1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mtmr4Q91XS1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mtmr4Q91XS1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mtmr4Q91XS1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mtmr4Q91XS1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mtmr4Q91XS1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mtmr4Q91XS1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms