Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Setd3Q91WC0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Setd3Q91WC0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Setd3Q91WC0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Setd3Q91WC0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Setd3Q91WC0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Setd3Q91WC0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Setd3Q91WC0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Setd3Q91WC0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Setd3Q91WC0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Setd3Q91WC0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Setd3Q91WC0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Setd3Q91WC0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Setd3Q91WC0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Setd3Q91WC0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Setd3Q91WC0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Setd3Q91WC0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Setd3Q91WC0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Setd3Q91WC0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Setd3Q91WC0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Setd3Q91WC0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Setd3Q91WC0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Setd3Q91WC0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Setd3Q91WC0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Setd3Q91WC0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Setd3Q91WC0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Setd3Q91WC0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Setd3Q91WC0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Setd3Q91WC0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Setd3Q91WC0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Setd3Q91WC0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Setd3Q91WC0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Setd3Q91WC0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Setd3Q91WC0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Setd3Q91WC0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Setd3Q91WC0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Setd3Q91WC0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Setd3Q91WC0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Setd3Q91WC0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Setd3Q91WC0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Setd3Q91WC0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Setd3Q91WC0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Setd3Q91WC0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Setd3Q91WC0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Setd3Q91WC0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Setd3Q91WC0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Setd3Q91WC0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Setd3Q91WC0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Setd3Q91WC0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Setd3Q91WC0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Setd3Q91WC0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Setd3Q91WC0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Setd3Q91WC0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms